淡水珍珠與海水珍珠(以南珠為例)的養殖技術是不同的，因此結構也有所不同。淡水珍珠是無核的，所有的成分都由珍珠質組成，因此若以淡水珍珠制成珍珠粉，不存在其它物質混雜。而海水珍珠是有核的，其核一般由豬蹄蚌的貝殼磨成，珍珠質僅覆蓋于表面，厚0.1~0.3毫米，生長期1年左右(淡水珠達4~5年)。但如果海水珍珠要加工成珍珠粉，必須先去掉內核，成本很高，也不易加工。 　　粉的區別 　　海水珍珠外圍的珍珠質較薄，若以海水珠全部磨粉，則其中只有少量的珍珠質，大部分是貝殼粉，所以藥用或美容不好，但如果海水珍珠要加工成珍珠粉，必須先去掉內核，成本很高，也不易加工。 　　另外，海水珍珠多因有內核，其形狀比較好控制，大多都比較規則，所以用做裝飾品或手飾價值會更高，只有少部分不規則無裝飾價值的海水珍珠用來做珍珠粉，所以海水珍珠粉的產量也不高。 　　在藥典中，海水珍珠和淡水珍珠是可以同等入藥的。科學分析發現，淡水珍珠與海水珍珠的成分是有區別的，淡水珍珠有3種氨基酸含量較海水低，2種與之持平。 　　一：珍珠粉，是由珍珠的成分經過科學方法加工而成，而其中海水珍珠是在礦物質及各類營養物質非常自然，豐富的大海里孕育出來的，海水珍珠在冰涼的大海里讓其更加清涼，滋潤，消炎等作用; 　　淡水珍珠是在湖或者人工池塘等淺水中生成的。 　　二者的生長環境不同，所含的礦物質及微量元素也肯定不同，其二者的 　　作用也有所不同。 　　二：海水珍珠的產量極低，一般平均三只貝才可產一粒海水珍珠; 　　淡水珍珠的產量倒是比較高，平均每一貝可產淡水珍珠20粒以上，所以可以想象，海水珍珠的價格比淡水珍珠的價格相對高得多; 　　三：海水有自然礦物質和營養成份，海水污染相對較少，浮生物也較多，珍珠比較自然(養殖的海水珍珠，也是靠大海的自身提供的營養，而不是用飼料另一養大的)經過大海的孕育，低產量的海水珍珠能確保其有機質含量，這對美容保健非常的關鍵的作用; 　　第四點：海水珍珠的開關比較正圓，光澤也好，而淡水珍珠的開關多呈橢圓形，米粒形等。 　　海水珍珠的光澤更加晶瑩剔透，光芒四射，更適合用于加工珠寶首飾。